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涵盖序列分析、结构预测、蛋白质信息查询、抗体风险评估等多个方向的实用小工具。无需配置环境、无需编写代码,通过对话交互即可完成专业分析任务,让研究人员专注于科学问题本身。
工具概览
设计理念
"抗体研发中,许多日常分析任务——序列编号、理化性质计算、结构检索——看似简单,却往往需要切换多个在线工具或编写脚本。我们将这些高频操作集成为对话式小工具,让研究人员用自然语言即可完成。"
涵盖 4 大类别、18 项工具,覆盖抗体研发日常分析的各个环节。所有工具均可通过对话交互免费使用。
一站式蛋白质数据库检索与注释
根据蛋白名称和物种搜索 UniProt 条目
查询单个 UniProt ID 的蛋白名称、功能、序列等信息
批量查询多个 UniProt ID
批量查询多个 UniProt ID 对应的 PDB 结构信息
获取 UniProt 蛋白的结构域信息并生成可视化图
摩尔浓度与质量浓度之间的单位换算
快速解读序列特征,辅助抗体工程设计
对多条 FASTA 序列进行全局比对,生成比对图和序列一致性矩阵
计算分子量、等电点、氨基酸频率等理化性质
对抗体序列进行 IMGT / Kabat / Chothia / Martin 编号,标注 CDR 和 FR 区域
AI 结构预测与分子间相互作用深度解析
使用 ImmuneBuilder 预测抗体 3D 结构(支持 VHH 纳米抗体和完整 mAb)
使用Chai1模型,对单体蛋白、多聚体蛋白、抗原、抗原抗体复合物等进行结构预测
根据 UniProt ID 获取 AlphaFold2 预测结构(PDB / CIF 格式)
对某蛋白的所有 PDB 结构进行聚类和结构比对
计算两个 PDB 结构链之间的 RMSD 值
从 PDB 文件中提取各链序列
识别蛋白-蛋白相互作用中的表位和副表位残基
使用 PLIP 进行详细的相互作用分析并生成可视化
序列级别风险位点识别,降低开发失败风险
识别抗体序列中的脱酰胺、氧化、免疫原性等风险位点
适用场景
轻量小工具适合处理研发中的高频、短周期辅助任务,例如信息查询、序列分析和结构分析。它们的价值在于快速确认基础信息、生成可视化材料,并为后续正式服务项目准备更清晰的输入。