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提供抗原结构与抗体序列,INSPIRE-SEEN 模型将以极高准确度预测结构性抗原表位,为抗体筛选与差异化设计提供关键依据。较传统实验方法成本降低百倍,较现有计算方法准确度提升 28%,从任务提交到结果产出仅需约 10~20 分钟。
验证数据
为什么需要?
"抗原表位直接与抗体的功能、作用机制、安全性以及有效性相关。结合表位决定了分子功能、临床适应症以及专利布局。提前识别和评估潜在结合表位,对优化药效、降低同质化风险至关重要。"
Key Advantages
实验手段周期通常需 4-8 周,单点实验成本从数万到数十万不等;传统高通量筛选与结构解析耗时费力。
部分蛋白和抗体表达难度极高,难以通过传统实验手段获取表位信息,尤其是复杂膜蛋白靶点。
现有的 AF2-multimer、HADDOCK 等计算方法,对抗原抗体结合模式预测的准确度仍然不足(约 50%)。
与现有抗体表位高度重叠,竞争机制雷同;肿瘤细胞通过表位突变等方式逃逸,缺乏差异化表位难以突破壁垒。
预测准确度较 AF2-multimer 提高 28%(从 50% 提升至 78%),基于内部海量冷冻电镜数据持续迭代训练。
从任务提交到结果产出仅需约 10~20 分钟,较传统湿实验成本降低百倍甚至千倍。
帮助研发团队避开已知抗体表位,在早期锁定新表位范围;高分值表位可定向用于文库筛选或细胞验证。
Validation
在 110 个已知表位的测试集中,INSPIRE-SEEN 展现出超越现有主流 AI 模型的能力。以 HER2 靶点为代表案例,验证模型预测表位与真实结合表位的吻合度。
在标准测试集上,INSPIRE-SEEN 的 Patch 二分类准确率达到 78%,远超 AF2-multimer 的 50%。
| Model | Recall | Precision | AUROC | AUPRC |
|---|---|---|---|---|
| AF2-multimer | 0.40 | 0.43 | 0.65 | 0.48 |
| 内部模型1 | 0.42 | 0.52 | 0.72 | 0.55 |
| 内部模型2 | 0.27 | 0.34 | 0.58 | 0.37 |
| INSPIRE-SEEN | 0.52 | 0.55 | 0.71 | 0.60 |
| Model | 比例 |
|---|---|
| AF2-multimer | 50% |
| 内部模型1 | 60% |
| 内部模型2 | 43% |
| INSPIRE-SEEN | 78% |
输入 HER2 抗原晶体结构,以及 Trastuzumab 和 Pertuzumab 抗体序列,INSPIRE-SEEN 模型对结构与序列特征进行深度学习分析,结合已知抗体-抗原相互作用数据,输出高可信度的潜在表位预测。结果显示模型预测的表位 patch 与真实结合表位存在重叠,且正确区分两条抗体的不同结合位置。

Pipeline
以亲和力预测 AI 模型为基础的表位预测,通过将抗原表面划分为多个 patch 候选区,并计算其与抗体间的亲和力,精准识别关键氨基酸残基。
系统先对抗原表面进行 Patch 划分,再通过亲和力模型完成排序,最终输出最可能参与结合的关键表位残基。
适用场景
适合已有抗体序列、但尚不清楚其在抗原表面可能结合区域的项目。
表位预测不是简单预测一个复合物姿态,而是把抗原表面拆成 Patch 并对结合可能性评分。模型基于内部冷冻电镜复合物数据持续训练,在已知表位测试集中表现优于 AF2-multimer,更适合做抗体表位定位。
通过比较不同候选抗体的高分 Patch,团队可以判断是否避开已知抗体表位、是否靠近目标功能区域,以及多个抗体之间是否有表位差异化空间。